位于西海北沿汇通祠内，1988年10月建成开馆。 汇通祠始建于元代，最初名镇水观音庵，郭守敬曾长期在此主持全国水系的水利建设设计，乾隆年间重修，改名汇通祠。1986年复建。建筑造型得体，格调素雅。

纪念馆分三个展厅，游人展示了我国元代天文学家和水利学家郭守敬的生平功绩。郭守敬曾制定《授时历》，精确推断以 365。3425天为一年，并主持制造过简仪、仰仪、高表等十多种天文仪器。这些成果都比欧洲早300年。他最大的成就是在水利方面，从“郭守敬与大都水利”展览中可窥见一斑。他一生中大部分时间从事水利建设，足迹遍及半个中国，完成大小百余处河渠泊堰的治理，对大都水利的建设贡献最为突出，曾主持开发当时为大都水源的白浮堰，开通惠河，促进了元大都的经济发展。馆内还展出有元代水关模型、元代粮船的铁锚和有关的书籍。此外还介绍了郭守敬在河北等地的治水功绩。