皇乾殿位于天坛公园祈年殿内，是一座庑殿式大殿，它是平时供奉祈谷坛祭祀正位和配位神版的大殿。皇乾殿建于明永乐十八年（1420年），由三座琉璃门与祭坛相通，蓝琉璃瓦庑殿顶，下面有汉白玉石栏杆的台基座。其檐下悬挂“皇乾殿”匾额为明朝嘉靖皇帝亲书。

神版均供奉在形状象屋宇的神龛里，每逢农历初一、十五，管理祀祭的衙署定时派官员扫尘、上香。祭祀的前一天皇帝、礼部尚书、太常寺卿等依次行礼上香后，再将神牌恭请至龙亭内安放，最后由銮仪卫抬至祈年殿内各相应神位安放，受祭。