吕祖宫为道教主流全真派圣，坐西朝东，山门的石门额上书“古刹火神庙”。主要建筑有钟楼、鼓楼、前殿3间、中殿3间、后殿5间及东西配殿各5间。这是一座现今保存较好的小型道教宫观。

走进吕祖宫，正面是吕祖殿，吕祖殿供奉的神像有纯阳祖师吕洞宾、药王孙思邈、财神赵公明。南配殿二楼供奉道德天尊，北配殿为修真堂，是住观道长早晚功课、谈经论道的场所。北院是现北京市道教协会所在地，清静优雅。吕祖宫虽然靠近二环，门外车水马龙，门内却情景脱俗。