普化寺是五台山建造时间最晚的一座寺庙，明崇祯年间（1628-1644），因这里建有一座玉皇阁，里面供着玉皇大帝，所以又有玉皇庙之称。现在建筑是民国十四年（1925）在玉皇庙的废墟上重建的。

普化寺以其独具特色的三教合一与砖石雕刻闻名于世。照壁用石与砖砌成，是五台山寺院中最长的照壁，正中嵌石刻“福禄寿三星”图案，两边是“文五别子”和“番溪求贤”，背面雕有观音、善财和龙女，并有花草作陪衬。这些石雕十分出色，可与龙泉寺照壁相婢美，是五台山砖石建筑中的杰作之一。

天王殿外砖石雕刻举目都是，有孙悟空大闹芭蕉洞、盘丝洞、无底洞、琵琶洞故事，还有石雕牧童吹笛、羊倌放羊、牧人赶像、老人骑驴过桥等，可以称得上是近代雕刻艺术佳作。这些砖石雕刻是民国年间南山寺普济和尚的弟子募化修建的，所以石雕内容与南山寺的一样，染上了儒教、道教的色彩。

天王殿内的雕工也一样精细，例如木雕弥勒佛龛，龛柱上雕有盘龙，称为“木雕盘龙柱”，可以将它左右旋转，令人叹为观止。此外，殿内正面还坐着弥勒佛，在弥勒佛背后是韦驮天神。与其它寺院的天王殿设置略有不同之处是，此殿有“哼哈二将”和“降龙”、“伏虎”。在天王殿背面的迎风和槛墙上，还雕刻着“二十四孝图”和降福、施寿、取仕、赐禄的四位天官。

1996年，山西省社科学院崔正森、山西著名摄影师李安保发现该寺背靠的山脉犹似静静仰卧着的一尊身体魁梧，长达3000余米的慈祥大佛。这一仰天大的佛两臂直伸，双手作弥陀定印，目置于小腹上面；这一仰天大佛两腿平伸，双脚蹬在南山上面，远远望去好似一位安祥慈悲的圣人，默默地躺在清水河畔，领略着五台山这块佛国圣地的兴旺繁荣。这尊仰天大佛既是文殊道场的又一灵迹，也是五台山旅游胜地的一大景观。